LCOV - code coverage report
Current view: top level - src - manybody_nequip.F (source / functions) Hit Total Coverage
Test: CP2K Regtests (git:b1f098b) Lines: 252 257 98.1 %
Date: 2024-05-05 06:30:09 Functions: 4 4 100.0 %

          Line data    Source code
       1             : !--------------------------------------------------------------------------------------------------!
       2             : !   CP2K: A general program to perform molecular dynamics simulations                              !
       3             : !   Copyright 2000-2024 CP2K developers group <https://cp2k.org>                                   !
       4             : !                                                                                                  !
       5             : !   SPDX-License-Identifier: GPL-2.0-or-later                                                      !
       6             : !--------------------------------------------------------------------------------------------------!
       7             : 
       8             : ! **************************************************************************************************
       9             : !> \par History
      10             : !>      nequip implementation
      11             : !> \author Gabriele Tocci
      12             : ! **************************************************************************************************
      13             : MODULE manybody_nequip
      14             : 
      15             :    USE atomic_kind_types,               ONLY: atomic_kind_type
      16             :    USE cell_types,                      ONLY: cell_type
      17             :    USE fist_neighbor_list_types,        ONLY: fist_neighbor_type,&
      18             :                                               neighbor_kind_pairs_type
      19             :    USE fist_nonbond_env_types,          ONLY: fist_nonbond_env_get,&
      20             :                                               fist_nonbond_env_set,&
      21             :                                               fist_nonbond_env_type,&
      22             :                                               nequip_data_type,&
      23             :                                               pos_type
      24             :    USE kinds,                           ONLY: dp,&
      25             :                                               int_8,&
      26             :                                               sp
      27             :    USE message_passing,                 ONLY: mp_para_env_type
      28             :    USE pair_potential_types,            ONLY: nequip_pot_type,&
      29             :                                               nequip_type,&
      30             :                                               pair_potential_pp_type,&
      31             :                                               pair_potential_single_type
      32             :    USE particle_types,                  ONLY: particle_type
      33             :    USE torch_api,                       ONLY: torch_dict_create,&
      34             :                                               torch_dict_get,&
      35             :                                               torch_dict_insert,&
      36             :                                               torch_dict_release,&
      37             :                                               torch_dict_type,&
      38             :                                               torch_model_eval,&
      39             :                                               torch_model_freeze,&
      40             :                                               torch_model_load
      41             :    USE util,                            ONLY: sort
      42             : #include "./base/base_uses.f90"
      43             : 
      44             :    IMPLICIT NONE
      45             : 
      46             :    PRIVATE
      47             :    PUBLIC :: setup_nequip_arrays, destroy_nequip_arrays, &
      48             :              nequip_energy_store_force_virial, nequip_add_force_virial
      49             :    CHARACTER(len=*), PARAMETER, PRIVATE :: moduleN = 'manybody_nequip'
      50             : 
      51             : CONTAINS
      52             : 
      53             : ! **************************************************************************************************
      54             : !> \brief ...
      55             : !> \param nonbonded ...
      56             : !> \param potparm ...
      57             : !> \param glob_loc_list ...
      58             : !> \param glob_cell_v ...
      59             : !> \param glob_loc_list_a ...
      60             : !> \param cell ...
      61             : !> \par History
      62             : !>      Implementation of the nequip potential - [gtocci] 2022
      63             : !> \author Gabriele Tocci - University of Zurich
      64             : ! **************************************************************************************************
      65           4 :    SUBROUTINE setup_nequip_arrays(nonbonded, potparm, glob_loc_list, glob_cell_v, glob_loc_list_a, cell)
      66             :       TYPE(fist_neighbor_type), POINTER                  :: nonbonded
      67             :       TYPE(pair_potential_pp_type), POINTER              :: potparm
      68             :       INTEGER, DIMENSION(:, :), POINTER                  :: glob_loc_list
      69             :       REAL(KIND=dp), DIMENSION(:, :), POINTER            :: glob_cell_v
      70             :       INTEGER, DIMENSION(:), POINTER                     :: glob_loc_list_a
      71             :       TYPE(cell_type), POINTER                           :: cell
      72             : 
      73             :       CHARACTER(LEN=*), PARAMETER :: routineN = 'setup_nequip_arrays'
      74             : 
      75             :       INTEGER                                            :: handle, i, iend, igrp, ikind, ilist, &
      76             :                                                             ipair, istart, jkind, nkinds, npairs, &
      77             :                                                             npairs_tot
      78           4 :       INTEGER, ALLOCATABLE, DIMENSION(:)                 :: work_list, work_list2
      79           4 :       INTEGER, DIMENSION(:, :), POINTER                  :: list
      80           4 :       REAL(KIND=dp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:, :)        :: rwork_list
      81             :       REAL(KIND=dp), DIMENSION(3)                        :: cell_v, cvi
      82             :       TYPE(neighbor_kind_pairs_type), POINTER            :: neighbor_kind_pair
      83             :       TYPE(pair_potential_single_type), POINTER          :: pot
      84             : 
      85           0 :       CPASSERT(.NOT. ASSOCIATED(glob_loc_list))
      86           4 :       CPASSERT(.NOT. ASSOCIATED(glob_loc_list_a))
      87           4 :       CPASSERT(.NOT. ASSOCIATED(glob_cell_v))
      88           4 :       CALL timeset(routineN, handle)
      89           4 :       npairs_tot = 0
      90           4 :       nkinds = SIZE(potparm%pot, 1)
      91         112 :       DO ilist = 1, nonbonded%nlists
      92         108 :          neighbor_kind_pair => nonbonded%neighbor_kind_pairs(ilist)
      93         108 :          npairs = neighbor_kind_pair%npairs
      94         108 :          IF (npairs == 0) CYCLE
      95         190 :          Kind_Group_Loop1: DO igrp = 1, neighbor_kind_pair%ngrp_kind
      96         136 :             istart = neighbor_kind_pair%grp_kind_start(igrp)
      97         136 :             iend = neighbor_kind_pair%grp_kind_end(igrp)
      98         136 :             ikind = neighbor_kind_pair%ij_kind(1, igrp)
      99         136 :             jkind = neighbor_kind_pair%ij_kind(2, igrp)
     100         136 :             pot => potparm%pot(ikind, jkind)%pot
     101         136 :             npairs = iend - istart + 1
     102         136 :             IF (pot%no_mb) CYCLE
     103         380 :             DO i = 1, SIZE(pot%type)
     104         272 :                IF (pot%type(i) == nequip_type) npairs_tot = npairs_tot + npairs
     105             :             END DO
     106             :          END DO Kind_Group_Loop1
     107             :       END DO
     108          12 :       ALLOCATE (work_list(npairs_tot))
     109           8 :       ALLOCATE (work_list2(npairs_tot))
     110          12 :       ALLOCATE (glob_loc_list(2, npairs_tot))
     111          12 :       ALLOCATE (glob_cell_v(3, npairs_tot))
     112             :       ! Fill arrays with data
     113           4 :       npairs_tot = 0
     114         112 :       DO ilist = 1, nonbonded%nlists
     115         108 :          neighbor_kind_pair => nonbonded%neighbor_kind_pairs(ilist)
     116         108 :          npairs = neighbor_kind_pair%npairs
     117         108 :          IF (npairs == 0) CYCLE
     118         190 :          Kind_Group_Loop2: DO igrp = 1, neighbor_kind_pair%ngrp_kind
     119         136 :             istart = neighbor_kind_pair%grp_kind_start(igrp)
     120         136 :             iend = neighbor_kind_pair%grp_kind_end(igrp)
     121         136 :             ikind = neighbor_kind_pair%ij_kind(1, igrp)
     122         136 :             jkind = neighbor_kind_pair%ij_kind(2, igrp)
     123         136 :             list => neighbor_kind_pair%list
     124         544 :             cvi = neighbor_kind_pair%cell_vector
     125         136 :             pot => potparm%pot(ikind, jkind)%pot
     126         136 :             npairs = iend - istart + 1
     127         136 :             IF (pot%no_mb) CYCLE
     128        1768 :             cell_v = MATMUL(cell%hmat, cvi)
     129         380 :             DO i = 1, SIZE(pot%type)
     130             :                ! NEQUIP
     131         272 :                IF (pot%type(i) == nequip_type) THEN
     132        8300 :                   DO ipair = 1, npairs
     133       48984 :                      glob_loc_list(:, npairs_tot + ipair) = list(:, istart - 1 + ipair)
     134       32792 :                      glob_cell_v(1:3, npairs_tot + ipair) = cell_v(1:3)
     135             :                   END DO
     136         136 :                   npairs_tot = npairs_tot + npairs
     137             :                END IF
     138             :             END DO
     139             :          END DO Kind_Group_Loop2
     140             :       END DO
     141             :       ! Order the arrays w.r.t. the first index of glob_loc_list
     142           4 :       CALL sort(glob_loc_list(1, :), npairs_tot, work_list)
     143        8168 :       DO ipair = 1, npairs_tot
     144        8168 :          work_list2(ipair) = glob_loc_list(2, work_list(ipair))
     145             :       END DO
     146        8168 :       glob_loc_list(2, :) = work_list2
     147           4 :       DEALLOCATE (work_list2)
     148          12 :       ALLOCATE (rwork_list(3, npairs_tot))
     149        8168 :       DO ipair = 1, npairs_tot
     150       32660 :          rwork_list(:, ipair) = glob_cell_v(:, work_list(ipair))
     151             :       END DO
     152       32660 :       glob_cell_v = rwork_list
     153           4 :       DEALLOCATE (rwork_list)
     154           4 :       DEALLOCATE (work_list)
     155          12 :       ALLOCATE (glob_loc_list_a(npairs_tot))
     156       16336 :       glob_loc_list_a = glob_loc_list(1, :)
     157           4 :       CALL timestop(handle)
     158           8 :    END SUBROUTINE setup_nequip_arrays
     159             : 
     160             : ! **************************************************************************************************
     161             : !> \brief ...
     162             : !> \param glob_loc_list ...
     163             : !> \param glob_cell_v ...
     164             : !> \param glob_loc_list_a ...
     165             : !> \par History
     166             : !>      Implementation of the nequip potential - [gtocci] 2022
     167             : !> \author Gabriele Tocci - University of Zurich
     168             : ! **************************************************************************************************
     169           4 :    SUBROUTINE destroy_nequip_arrays(glob_loc_list, glob_cell_v, glob_loc_list_a)
     170             :       INTEGER, DIMENSION(:, :), POINTER                  :: glob_loc_list
     171             :       REAL(KIND=dp), DIMENSION(:, :), POINTER            :: glob_cell_v
     172             :       INTEGER, DIMENSION(:), POINTER                     :: glob_loc_list_a
     173             : 
     174           4 :       IF (ASSOCIATED(glob_loc_list)) THEN
     175           4 :          DEALLOCATE (glob_loc_list)
     176             :       END IF
     177           4 :       IF (ASSOCIATED(glob_loc_list_a)) THEN
     178           4 :          DEALLOCATE (glob_loc_list_a)
     179             :       END IF
     180           4 :       IF (ASSOCIATED(glob_cell_v)) THEN
     181           4 :          DEALLOCATE (glob_cell_v)
     182             :       END IF
     183             : 
     184           4 :    END SUBROUTINE destroy_nequip_arrays
     185             : 
     186             : ! **************************************************************************************************
     187             : !> \brief ...
     188             : !> \param nonbonded ...
     189             : !> \param particle_set ...
     190             : !> \param cell ...
     191             : !> \param atomic_kind_set ...
     192             : !> \param potparm ...
     193             : !> \param nequip ...
     194             : !> \param glob_loc_list_a ...
     195             : !> \param r_last_update_pbc ...
     196             : !> \param pot_nequip ...
     197             : !> \param fist_nonbond_env ...
     198             : !> \param para_env ...
     199             : !> \par History
     200             : !>      Implementation of the nequip potential - [gtocci] 2022
     201             : !> \author Gabriele Tocci - University of Zurich
     202             : ! **************************************************************************************************
     203           4 :    SUBROUTINE nequip_energy_store_force_virial(nonbonded, particle_set, cell, atomic_kind_set, &
     204             :                                                potparm, nequip, glob_loc_list_a, r_last_update_pbc, &
     205             :                                                pot_nequip, fist_nonbond_env, para_env)
     206             : 
     207             :       TYPE(fist_neighbor_type), POINTER                  :: nonbonded
     208             :       TYPE(particle_type), POINTER                       :: particle_set(:)
     209             :       TYPE(cell_type), POINTER                           :: cell
     210             :       TYPE(atomic_kind_type), POINTER                    :: atomic_kind_set(:)
     211             :       TYPE(pair_potential_pp_type), POINTER              :: potparm
     212             :       TYPE(nequip_pot_type), POINTER                     :: nequip
     213             :       INTEGER, DIMENSION(:), POINTER                     :: glob_loc_list_a
     214             :       TYPE(pos_type), DIMENSION(:), POINTER              :: r_last_update_pbc
     215             :       REAL(kind=dp)                                      :: pot_nequip
     216             :       TYPE(fist_nonbond_env_type), POINTER               :: fist_nonbond_env
     217             :       TYPE(mp_para_env_type), OPTIONAL, POINTER          :: para_env
     218             : 
     219             :       CHARACTER(LEN=*), PARAMETER :: routineN = 'nequip_energy_store_force_virial'
     220             : 
     221             :       INTEGER :: atom_a, atom_b, handle, i, iat, iat_use, iend, ifirst, igrp, ikind, ilast, ilist, &
     222             :          ipair, istart, iunique, jkind, junique, mpair, n_atoms, n_atoms_use, nedges, nedges_tot, &
     223             :          nloc_size, npairs, nunique
     224           4 :       INTEGER(kind=int_8), ALLOCATABLE                   :: atom_types(:)
     225           4 :       INTEGER(kind=int_8), ALLOCATABLE, DIMENSION(:, :)  :: edge_index, t_edge_index, temp_edge_index
     226           4 :       INTEGER, ALLOCATABLE, DIMENSION(:)                 :: displ, displ_cell, edge_count, &
     227           4 :                                                             edge_count_cell, work_list
     228           4 :       INTEGER, DIMENSION(:, :), POINTER                  :: list, sort_list
     229           4 :       LOGICAL, ALLOCATABLE                               :: use_atom(:)
     230             :       REAL(kind=dp)                                      :: drij, lattice(3, 3), rab2_max, rij(3)
     231           4 :       REAL(kind=dp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:, :)        :: edge_cell_shifts, pos, &
     232           4 :                                                             temp_edge_cell_shifts
     233             :       REAL(kind=dp), DIMENSION(3)                        :: cell_v, cvi
     234           4 :       REAL(kind=dp), DIMENSION(:, :), POINTER            :: atomic_energy, forces, total_energy
     235             :       REAL(kind=sp)                                      :: lattice_sp(3, 3)
     236           4 :       REAL(kind=sp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:, :)        :: edge_cell_shifts_sp, pos_sp
     237           4 :       REAL(kind=sp), DIMENSION(:, :), POINTER            :: atomic_energy_sp, forces_sp, &
     238           4 :                                                             total_energy_sp
     239             :       TYPE(neighbor_kind_pairs_type), POINTER            :: neighbor_kind_pair
     240             :       TYPE(nequip_data_type), POINTER                    :: nequip_data
     241             :       TYPE(pair_potential_single_type), POINTER          :: pot
     242             :       TYPE(torch_dict_type)                              :: inputs, outputs
     243             : 
     244           4 :       CALL timeset(routineN, handle)
     245             : 
     246           4 :       NULLIFY (total_energy, atomic_energy, forces, total_energy_sp, atomic_energy_sp, forces_sp)
     247           4 :       n_atoms = SIZE(particle_set)
     248          12 :       ALLOCATE (use_atom(n_atoms))
     249         202 :       use_atom = .FALSE.
     250             : 
     251          12 :       DO ikind = 1, SIZE(atomic_kind_set)
     252          28 :       DO jkind = 1, SIZE(atomic_kind_set)
     253          16 :          pot => potparm%pot(ikind, jkind)%pot
     254          40 :          DO i = 1, SIZE(pot%type)
     255          16 :             IF (pot%type(i) /= nequip_type) CYCLE
     256         824 :             DO iat = 1, n_atoms
     257         792 :                IF (particle_set(iat)%atomic_kind%kind_number == ikind .OR. &
     258         610 :                    particle_set(iat)%atomic_kind%kind_number == jkind) use_atom(iat) = .TRUE.
     259             :             END DO ! iat
     260             :          END DO ! i
     261             :       END DO ! jkind
     262             :       END DO ! ikind
     263         202 :       n_atoms_use = COUNT(use_atom)
     264             : 
     265             :       ! get nequip_data to save force, virial info and to load model
     266           4 :       CALL fist_nonbond_env_get(fist_nonbond_env, nequip_data=nequip_data)
     267           4 :       IF (.NOT. ASSOCIATED(nequip_data)) THEN
     268          56 :          ALLOCATE (nequip_data)
     269           4 :          CALL fist_nonbond_env_set(fist_nonbond_env, nequip_data=nequip_data)
     270           4 :          NULLIFY (nequip_data%use_indices, nequip_data%force)
     271           4 :          CALL torch_model_load(nequip_data%model, pot%set(1)%nequip%nequip_file_name)
     272           4 :          CALL torch_model_freeze(nequip_data%model)
     273             :       END IF
     274           4 :       IF (ASSOCIATED(nequip_data%force)) THEN
     275           0 :          IF (SIZE(nequip_data%force, 2) /= n_atoms_use) THEN
     276           0 :             DEALLOCATE (nequip_data%force, nequip_data%use_indices)
     277             :          END IF
     278             :       END IF
     279           4 :       IF (.NOT. ASSOCIATED(nequip_data%force)) THEN
     280          12 :          ALLOCATE (nequip_data%force(3, n_atoms_use))
     281          12 :          ALLOCATE (nequip_data%use_indices(n_atoms_use))
     282             :       END IF
     283             : 
     284             :       iat_use = 0
     285         202 :       DO iat = 1, n_atoms_use
     286         202 :          IF (use_atom(iat)) THEN
     287         198 :             iat_use = iat_use + 1
     288         198 :             nequip_data%use_indices(iat_use) = iat
     289             :          END IF
     290             :       END DO
     291             : 
     292           4 :       nedges = 0
     293          12 :       ALLOCATE (edge_index(2, SIZE(glob_loc_list_a)))
     294          12 :       ALLOCATE (edge_cell_shifts(3, SIZE(glob_loc_list_a)))
     295         112 :       DO ilist = 1, nonbonded%nlists
     296         108 :          neighbor_kind_pair => nonbonded%neighbor_kind_pairs(ilist)
     297         108 :          npairs = neighbor_kind_pair%npairs
     298         108 :          IF (npairs == 0) CYCLE
     299         190 :          Kind_Group_Loop_Nequip: DO igrp = 1, neighbor_kind_pair%ngrp_kind
     300         136 :             istart = neighbor_kind_pair%grp_kind_start(igrp)
     301         136 :             iend = neighbor_kind_pair%grp_kind_end(igrp)
     302         136 :             ikind = neighbor_kind_pair%ij_kind(1, igrp)
     303         136 :             jkind = neighbor_kind_pair%ij_kind(2, igrp)
     304         136 :             list => neighbor_kind_pair%list
     305         544 :             cvi = neighbor_kind_pair%cell_vector
     306         136 :             pot => potparm%pot(ikind, jkind)%pot
     307         380 :             DO i = 1, SIZE(pot%type)
     308         136 :                IF (pot%type(i) /= nequip_type) CYCLE
     309         136 :                rab2_max = pot%set(i)%nequip%rcutsq
     310        1768 :                cell_v = MATMUL(cell%hmat, cvi)
     311         136 :                pot => potparm%pot(ikind, jkind)%pot
     312         136 :                nequip => pot%set(i)%nequip
     313         136 :                npairs = iend - istart + 1
     314         272 :                IF (npairs /= 0) THEN
     315         680 :                   ALLOCATE (sort_list(2, npairs), work_list(npairs))
     316       49256 :                   sort_list = list(:, istart:iend)
     317             :                   ! Sort the list of neighbors, this increases the efficiency for single
     318             :                   ! potential contributions
     319         136 :                   CALL sort(sort_list(1, :), npairs, work_list)
     320        8300 :                   DO ipair = 1, npairs
     321        8300 :                      work_list(ipair) = sort_list(2, work_list(ipair))
     322             :                   END DO
     323        8300 :                   sort_list(2, :) = work_list
     324             :                   ! find number of unique elements of array index 1
     325             :                   nunique = 1
     326        8164 :                   DO ipair = 1, npairs - 1
     327        8164 :                      IF (sort_list(1, ipair + 1) /= sort_list(1, ipair)) nunique = nunique + 1
     328             :                   END DO
     329         136 :                   ipair = 1
     330         136 :                   junique = sort_list(1, ipair)
     331         136 :                   ifirst = 1
     332        1204 :                   DO iunique = 1, nunique
     333        1068 :                      atom_a = junique
     334        1068 :                      IF (glob_loc_list_a(ifirst) > atom_a) CYCLE
     335      327979 :                      DO mpair = ifirst, SIZE(glob_loc_list_a)
     336      327979 :                         IF (glob_loc_list_a(mpair) == atom_a) EXIT
     337             :                      END DO
     338       91383 :                      ifirst = mpair
     339       91383 :                      DO mpair = ifirst, SIZE(glob_loc_list_a)
     340       91383 :                         IF (glob_loc_list_a(mpair) /= atom_a) EXIT
     341             :                      END DO
     342        1068 :                      ilast = mpair - 1
     343        1068 :                      nloc_size = 0
     344        1068 :                      IF (ifirst /= 0) nloc_size = ilast - ifirst + 1
     345        9232 :                      DO WHILE (ipair <= npairs)
     346        9096 :                         IF (sort_list(1, ipair) /= junique) EXIT
     347        8164 :                         atom_b = sort_list(2, ipair)
     348       32656 :                         rij(:) = r_last_update_pbc(atom_b)%r(:) - r_last_update_pbc(atom_a)%r(:) + cell_v
     349       32656 :                         drij = DOT_PRODUCT(rij, rij)
     350        8164 :                         ipair = ipair + 1
     351        9232 :                         IF (drij <= rab2_max) THEN
     352        4718 :                            nedges = nedges + 1
     353       14154 :                            edge_index(:, nedges) = [atom_a - 1, atom_b - 1]
     354       18872 :                            edge_cell_shifts(:, nedges) = cvi
     355             :                         END IF
     356             :                      END DO
     357        1068 :                      ifirst = ilast + 1
     358        1204 :                      IF (ipair <= npairs) junique = sort_list(1, ipair)
     359             :                   END DO
     360         136 :                   DEALLOCATE (sort_list, work_list)
     361             :                END IF
     362             :             END DO
     363             :          END DO Kind_Group_Loop_Nequip
     364             :       END DO
     365             : 
     366           4 :       nequip => pot%set(1)%nequip
     367             : 
     368          12 :       ALLOCATE (edge_count(para_env%num_pe))
     369           8 :       ALLOCATE (edge_count_cell(para_env%num_pe))
     370           8 :       ALLOCATE (displ_cell(para_env%num_pe))
     371           8 :       ALLOCATE (displ(para_env%num_pe))
     372             : 
     373           4 :       CALL para_env%allgather(nedges, edge_count)
     374          12 :       nedges_tot = SUM(edge_count)
     375             : 
     376          12 :       ALLOCATE (temp_edge_index(2, nedges))
     377       14158 :       temp_edge_index(:, :) = edge_index(:, :nedges)
     378           4 :       DEALLOCATE (edge_index)
     379          12 :       ALLOCATE (temp_edge_cell_shifts(3, nedges))
     380       18876 :       temp_edge_cell_shifts(:, :) = edge_cell_shifts(:, :nedges)
     381           4 :       DEALLOCATE (edge_cell_shifts)
     382             : 
     383          12 :       ALLOCATE (edge_index(2, nedges_tot))
     384          12 :       ALLOCATE (edge_cell_shifts(3, nedges_tot))
     385           8 :       ALLOCATE (t_edge_index(nedges_tot, 2))
     386             : 
     387          12 :       edge_count_cell(:) = edge_count*3
     388          12 :       edge_count = edge_count*2
     389           4 :       displ(1) = 0
     390           4 :       displ_cell(1) = 0
     391           8 :       DO ipair = 2, para_env%num_pe
     392           4 :          displ(ipair) = displ(ipair - 1) + edge_count(ipair - 1)
     393           8 :          displ_cell(ipair) = displ_cell(ipair - 1) + edge_count_cell(ipair - 1)
     394             :       END DO
     395             : 
     396           4 :       CALL para_env%allgatherv(temp_edge_cell_shifts, edge_cell_shifts, edge_count_cell, displ_cell)
     397           4 :       CALL para_env%allgatherv(temp_edge_index, edge_index, edge_count, displ)
     398             : 
     399       18884 :       t_edge_index(:, :) = TRANSPOSE(edge_index)
     400           4 :       DEALLOCATE (temp_edge_index, temp_edge_cell_shifts, edge_index)
     401             : 
     402          52 :       lattice = cell%hmat/nequip%unit_cell_val
     403          52 :       lattice_sp = REAL(lattice, kind=sp)
     404             : 
     405           4 :       iat_use = 0
     406          20 :       ALLOCATE (pos(3, n_atoms_use), atom_types(n_atoms_use))
     407             : 
     408         202 :       DO iat = 1, n_atoms_use
     409         198 :          IF (.NOT. use_atom(iat)) CYCLE
     410         198 :          iat_use = iat_use + 1
     411         198 :          atom_types(iat_use) = particle_set(iat)%atomic_kind%kind_number - 1
     412         796 :          pos(:, iat) = r_last_update_pbc(iat)%r(:)/nequip%unit_coords_val
     413             :       END DO
     414             : 
     415           4 :       CALL torch_dict_create(inputs)
     416           4 :       IF (nequip%do_nequip_sp) THEN
     417          10 :          ALLOCATE (pos_sp(3, n_atoms_use), edge_cell_shifts_sp(3, nedges_tot))
     418          26 :          pos_sp(:, :) = REAL(pos(:, :), kind=sp)
     419          50 :          edge_cell_shifts_sp(:, :) = REAL(edge_cell_shifts(:, :), kind=sp)
     420           2 :          CALL torch_dict_insert(inputs, "pos", pos_sp)
     421           2 :          CALL torch_dict_insert(inputs, "edge_cell_shift", edge_cell_shifts_sp)
     422           2 :          CALL torch_dict_insert(inputs, "cell", lattice_sp)
     423             :       ELSE
     424           2 :          CALL torch_dict_insert(inputs, "pos", pos)
     425           2 :          CALL torch_dict_insert(inputs, "edge_cell_shift", edge_cell_shifts)
     426           2 :          CALL torch_dict_insert(inputs, "cell", lattice)
     427             :       END IF
     428             : 
     429           4 :       CALL torch_dict_insert(inputs, "edge_index", t_edge_index)
     430           4 :       CALL torch_dict_insert(inputs, "atom_types", atom_types)
     431             : 
     432           4 :       CALL torch_dict_create(outputs)
     433             : 
     434           4 :       CALL torch_model_eval(nequip_data%model, inputs, outputs)
     435             : 
     436           4 :       IF (nequip%do_nequip_sp) THEN
     437           2 :          CALL torch_dict_get(outputs, "total_energy", total_energy_sp)
     438           2 :          CALL torch_dict_get(outputs, "atomic_energy", atomic_energy_sp)
     439           2 :          CALL torch_dict_get(outputs, "forces", forces_sp)
     440           2 :          pot_nequip = REAL(total_energy_sp(1, 1), kind=dp)*nequip%unit_energy_val
     441          26 :          nequip_data%force(:, :) = REAL(forces_sp(:, :), kind=dp)*nequip%unit_forces_val
     442           2 :          DEALLOCATE (pos_sp, edge_cell_shifts_sp, total_energy_sp, atomic_energy_sp, forces_sp)
     443             :       ELSE
     444           2 :          CALL torch_dict_get(outputs, "total_energy", total_energy)
     445           2 :          CALL torch_dict_get(outputs, "atomic_energy", atomic_energy)
     446           2 :          CALL torch_dict_get(outputs, "forces", forces)
     447           2 :          pot_nequip = total_energy(1, 1)*nequip%unit_energy_val
     448        1540 :          nequip_data%force(:, :) = forces(:, :)*nequip%unit_forces_val
     449           2 :          DEALLOCATE (pos, edge_cell_shifts, total_energy, atomic_energy, forces)
     450             :       END IF
     451             : 
     452           4 :       CALL torch_dict_release(inputs)
     453           4 :       CALL torch_dict_release(outputs)
     454             : 
     455           4 :       DEALLOCATE (t_edge_index, atom_types)
     456             : 
     457             :       ! account for double counting from multiple MPI processes
     458           4 :       IF (PRESENT(para_env)) THEN
     459           4 :          pot_nequip = pot_nequip/REAL(para_env%num_pe, dp)
     460         796 :          nequip_data%force = nequip_data%force/REAL(para_env%num_pe, dp)
     461             :       END IF
     462             : 
     463           4 :       CALL timestop(handle)
     464           8 :    END SUBROUTINE nequip_energy_store_force_virial
     465             : 
     466             : ! **************************************************************************************************
     467             : !> \brief ...
     468             : !> \param fist_nonbond_env ...
     469             : !> \param f_nonbond ...
     470             : !> \param pv_nonbond ...
     471             : !> \param use_virial ...
     472             : ! **************************************************************************************************
     473           4 :    SUBROUTINE nequip_add_force_virial(fist_nonbond_env, f_nonbond, pv_nonbond, use_virial)
     474             : 
     475             :       TYPE(fist_nonbond_env_type), POINTER               :: fist_nonbond_env
     476             :       REAL(KIND=dp), DIMENSION(:, :), INTENT(INOUT)      :: f_nonbond, pv_nonbond
     477             :       LOGICAL, INTENT(IN)                                :: use_virial
     478             : 
     479             :       INTEGER                                            :: iat, iat_use
     480             :       REAL(KIND=dp), DIMENSION(3, 3)                     :: virial
     481             :       TYPE(nequip_data_type), POINTER                    :: nequip_data
     482             : 
     483           4 :       CALL fist_nonbond_env_get(fist_nonbond_env, nequip_data=nequip_data)
     484             : 
     485           4 :       IF (use_virial) THEN
     486             :          virial = 0.0_dp
     487           0 :          pv_nonbond = pv_nonbond + virial
     488           0 :          CPABORT("Stress tensor for NequIP not yet implemented")
     489             :       END IF
     490             : 
     491         202 :       DO iat_use = 1, SIZE(nequip_data%use_indices)
     492         198 :          iat = nequip_data%use_indices(iat_use)
     493         198 :          CPASSERT(iat >= 1 .AND. iat <= SIZE(f_nonbond, 2))
     494         796 :          f_nonbond(1:3, iat) = f_nonbond(1:3, iat) + nequip_data%force(1:3, iat_use)
     495             :       END DO
     496             : 
     497           4 :    END SUBROUTINE nequip_add_force_virial
     498             : END MODULE manybody_nequip
     499             : 

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